MeCab 0.92 + MinGw 環境で make check を実行するとエラーになることに気づきました。(これは MeCab 0.91 でもエラーになります。)

エラーの内容を確認すると、予め用意されている test.gld とテスト時に作成される test.out の改行コードの違いによる差で発生するものでした。
これは UNIX 環境でのテストを想定しているためでしょう。

tests/run.sh, tests/run2.sh の diff に -b オプションを付けてみるとエラーはなくなりました。
このことから、テストに失敗するのはテストプログラム側の問題であって、MeCab 0.92 の動作自体には問題はないということのようです。